Липиды играют ключевую роль в обмене веществами и энергией между внешней средой и клеткой. Специалисты разработали программу PCAlipids, способную представлять информацию в виде наглядных графиков и анализировать динамику. Данные инструменты значительно ускоряют исследование воздействия разных веществ и условий на липиды.
Суть программы в том, что она анализирует структуру отдельных молекул липидов в определенный момент, а также описывает изменения конформаций во времени. Для этого используют методику главных компонентов, которая позволяет выделить самые значимые элементы в данных. Появление таких экспериментальных данных позволит сравнить вычисленные благодаря компьютерному моделированию липиды с реальной жизнью и таким образом улучшить параметры моделирования.
PCAlipids сначала ищет группы атомов, которые двигаются вместе. Первый базисный вектор новой системы координат определяет включающее самое большое число атомов липида коллективное движение. Второму вектору соответствует следующее по значимости коллективное движение, и так далее.
